O Conselho Geral é o órgão de direção estratégica do Agrupamento, ao qual compete definir as orientações fundamentais da sua atividade, garantindo a participação e a representação dos diversos setores da comunidade educativa. No exercício das suas atribuições, aprova os principais instrumentos de autonomia, designadamente o Projeto Educativo, o Regulamento Interno e o Plano Plurianual de Atividades do Agrupamento (PPAA), acompanha e avalia a ação do Diretor e participa no respetivo processo de avaliação, assegurando a articulação entre a escola e a comunidade envolvente. A sua intervenção concorre para a construção de uma visão estratégica partilhada, para o reforço da autonomia da escola e para a melhoria da qualidade e sustentabilidade da ação educativa do Agrupamento.

Nos termos da legislação em vigor, o Diretor é o órgão unipessoal de administração e gestão do Agrupamento, competindo-lhe a condução da sua atividade nas áreas pedagógica, cultural, administrativa, financeira e patrimonial. Cabe-lhe assegurar a liderança estratégica e a gestão global da organização, executar as orientações e decisões consagradas nos instrumentos de autonomia, bem como garantir o regular funcionamento dos serviços e estruturas educativas. No exercício das suas funções, o Diretor promove a articulação entre os diferentes órgãos e níveis de gestão, orientando a ação educativa para a melhoria da qualidade do serviço prestado e para a promoção do sucesso e da inclusão dos alunos.

O Conselho Pedagógico é o órgão de coordenação, supervisão pedagógica e orientação educativa do Agrupamento, com intervenção nos domínios pedagógico-didático, da orientação e acompanhamento dos alunos e da formação inicial e contínua do pessoal docente. Compete-lhe acompanhar e avaliar o desenvolvimento da ação educativa, apreciar e emitir parecer sobre propostas e matérias de natureza pedagógica da sua competência, bem como contribuir para a definição e implementação de práticas educativas coerentes e fundamentadas. A sua atuação visa apoiar a tomada de decisões informadas e promover a melhoria contínua da qualidade do serviço educativo prestado pelo Agrupamento.

O Conselho Administrativo é o órgão deliberativo em matéria administrativo-financeira do Agrupamento, competindo-lhe a gestão dos recursos financeiros e patrimoniais, nos termos da legislação em vigor. No exercício das suas atribuições, aprova o orçamento, acompanha a sua execução e delibera sobre a conta de gerência, assegurando a legalidade, a transparência e a eficiência na utilização dos recursos. A sua atuação contribui para a sustentabilidade financeira do Agrupamento e para o suporte adequado à concretização das opções estratégicas e educativas definidas nos instrumentos de autonomia.